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dc.contributor.authorMarinotti, Osvaldo-
dc.contributor.authorCerqueira, Gustavo C.-
dc.contributor.authorAlmeida, Luiz Gonzaga Paula de-
dc.contributor.authorFerro, Maria Inês Tiraboschi-
dc.contributor.authorLoreto, Elgion Lucio da Silva-
dc.contributor.authorZaha, Arnaldo-
dc.contributor.authorTeixeira, Santuza M. R.-
dc.contributor.authorWespiser, Adam R.-
dc.contributor.authorSilva, Alexandre Almeida E.-
dc.contributor.authorSchlindwein, Aline Daiane-
dc.contributor.authorPacheco, Ana Carolina Landim-
dc.contributor.authorSilva, Artur Luiz da Costa da-
dc.contributor.authorGraveley, Brenton R.-
dc.contributor.authorWalenz, Brian P.-
dc.contributor.authorLima, Bruna de Araújo-
dc.contributor.authorRibeiro, Carlos Alexandre Gomes-
dc.contributor.authorNunes-Silva, Carlos Gustavo-
dc.contributor.authorCarvalho, Carlos Roberto de-
dc.contributor.authorSoares, Célia Maria de Almeida-
dc.contributor.authorMenezes, Claudia Beatriz Afonso de-
dc.contributor.authorMatiolli, Cleverson-
dc.contributor.authorCaffrey, Daniel-
dc.contributor.authorAraújo, Demetrius Antonio M.-
dc.contributor.authorOliveira, Diana Magalhães de-
dc.contributor.authorGolenbock, Douglas-
dc.contributor.authorGrisard, Edmundo Carlos-
dc.contributor.authorFantinatti-Garboggini, Fabiana-
dc.contributor.authorCarvalho, Fabíola Marques de-
dc.contributor.authorBarcellos, Fernando Gomes-
dc.contributor.authorProsdocimi, Francisco-
dc.contributor.authorMay, Gemma-
dc.contributor.authorAzevedo Junior, Gilson Martins de-
dc.contributor.authorGuimarães, Giselle Moura-
dc.contributor.authorGoldman, Gustavo Henrique-
dc.contributor.authorPadilha, Itácio Q. M.-
dc.contributor.authorBatista, Jacqueline da Silva-
dc.contributor.authorFerro, Jesus Aparecido-
dc.contributor.authorRibeiro, José M. C.-
dc.contributor.authorFietto, Juliana Lopes Rangel-
dc.contributor.authorDabbas, Karina Maia-
dc.contributor.authorCerdeira, Louise-
dc.contributor.authorAgnez-Lima, Lucymara Fassarella-
dc.contributor.authorBrocchi, Marcelo-
dc.contributor.authorCarvalho, Marcos Oliveira de-
dc.contributor.authorMelo Teixeira, Marcus de-
dc.contributor.authorMascena Diniz Maia, Maria de-
dc.contributor.authorGoldman, Maria Helena S.-
dc.contributor.authorSchneider, Maria Paula Cruz-
dc.contributor.authorFelipe, Maria Sueli Soares-
dc.contributor.authorHungria, Mariangela-
dc.contributor.authorNicolás, Marisa Fabiana-
dc.contributor.authorPereira, Maristela-
dc.contributor.authorMontes, Martín Alejandro-
dc.contributor.authorCantão, Maurício E.-
dc.contributor.authorVincentz, Michel-
dc.contributor.authorRafael, Miriam Silva-
dc.contributor.authorSilverman, Neal-
dc.contributor.authorStoco, Patrícia Hermes-
dc.contributor.authorSouza, Rangel Celso-
dc.contributor.authorVicentini, Renato-
dc.contributor.authorGazzinelli, Ricardo Tostes-
dc.contributor.authorOliveira Neves, Rogério de-
dc.contributor.authorSilva, Rosane-
dc.contributor.authorAstolfi-Filho, Spartaco-
dc.contributor.authorMaciel, Talles Eduardo Ferreira-
dc.contributor.authorÜrményi, Turàn P.-
dc.contributor.authorTadei, Wanderli Pedro-
dc.contributor.authorCamargo, Erney Plessmann-
dc.contributor.authorVasconcelos, Ana Tereza Ribeiro de-
dc.identifier.citationNucleic Acids Research, v. 41, n. 15, p. 7387-7400, 2013.-
dc.description.abstractAnopheles darlingi is the principal neotropical malaria vector, responsible for more than a million cases of malaria per year on the American continent. Anopheles darlingi diverged from the African and Asian malaria vectors ∼100 million years ago (mya) and successfully adapted to the New World environment. Here we present an annotated reference A. darlingi genome, sequenced from a wild population of males and females collected in the Brazilian Amazon. A total of 10 481 predicted protein-coding genes were annotated, 72% of which have their closest counterpart in Anopheles gambiae and 21% have highest similarity with other mosquito species. In spite of a long period of divergent evolution, conserved gene synteny was observed between A. darlingi and A. gambiae. More than 10 million single nucleotide polymorphisms and short indels with potential use as genetic markers were identified. Transposable elements correspond to 2.3% of the A. darlingi genome. Genes associated with hematophagy, immunity and insecticide resistance, directly involved in vectorhuman and vectorparasite interactions, were identified and discussed. This study represents the first effort to sequence the genome of a neotropical malaria vector, and opens a new window through which we can contemplate the evolutionary history of anopheline mosquitoes. It also provides valuable information that may lead to novel strategies to reduce malaria transmission on the South American continent. The A. darlingi genome is accessible at darlingi. © 2013 The Author(s).en
dc.description.sponsorshipNational Institute of Allergy and Infectious Diseases-
dc.description.sponsorshipNational Institutes of Health-
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)-
dc.subjectAnopheles darlingi-
dc.subjectAnopheles gambiae-
dc.subjectcircadian rhythm-
dc.subjectgene identification-
dc.subjectgene sequence-
dc.subjectgenetic conservation-
dc.subjectgenetic marker-
dc.subjectgenome analysis-
dc.subjectgenome size-
dc.subjectindel mutation-
dc.subjectinsect genetics-
dc.subjectinsecticide resistance-
dc.subjectpriority journal-
dc.subjectsequence homology-
dc.subjectsingle nucleotide polymorphism-
dc.subjectxenobiotic metabolism-
dc.titleThe Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vectoren
dc.contributor.institutionUniversity of California Irvine-
dc.contributor.institutionBroad Institute of Harvard and Massachusetts-
dc.contributor.institutionLaboratório Nacional de Computação Científica-
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Santa Maria (UFSM)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG)-
dc.contributor.institutionUniversity of Massachusetts-
dc.contributor.institutionFundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Santa Catarina (UFSC)-
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual do Ceará (UECE)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Piauí (UFPI)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Pará (UFPA)-
dc.contributor.institutionUniversity of Connecticut Health Center-
dc.contributor.institutionJ. Craig Venter Institute-
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Viçosa (UFV)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Amazonas (UFAM)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de Goiás (UFG)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal da Paraíba (UFPB)-
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Londrina (UEL)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)-
dc.contributor.institutionInstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)-
dc.contributor.institutionLaboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE)-
dc.contributor.institutionUniversidade de São Paulo (USP)-
dc.contributor.institutionNational Institutes of Health (NIH)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)-
dc.contributor.institutionUniversidade de Brasília (UnB)-
dc.contributor.institutionUniversidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)-
dc.contributor.institutionUniversidade Católica de Brasília (UCB)-
dc.contributor.institutionEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)-
dc.description.affiliationDepartment of Molecular Biology and Biochemistry University of California Irvine, Irvine, CA 92697-
dc.description.affiliationInstitute of Technology Broad Institute of Harvard and Massachusetts, Cambridge, MA 02141-
dc.description.affiliationLaboratório de Bioinformática Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ 25651-075-
dc.description.affiliationDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal UNESP - Universidade Estadual, Paulista, SP 14884-900-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria, RS 97105-900-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Molecular e Biotecnologia Centro de Biotecnologia Universidade Federal Do Rio Grande Do sul, Porto Alegre, RS 91501-970-
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Imunologia Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270901-
dc.description.affiliationDepartment of Medicine University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655-
dc.description.affiliationLaboratório de Entomologia Médica IPEPATRO FIOCRUZ, Porto Velho, RO 76812-245-
dc.description.affiliationDepartamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis, SC 88040-900-
dc.description.affiliationCentro de Ciências da Saúde Universidade Estadual Do Ceará, Fortaleza, CE 62042-280-
dc.description.affiliationDepartamento de Ciências Biológicas Campus Senador Helvídio Nunes de Barros Universidade Federal Do Piauí, Picos, PI 60740-000-
dc.description.affiliationDepartamento de Genética Instituto de Ciências Biológicas Universidade Federal Do Pará, Belém, PA 66075-900-
dc.description.affiliationDepartment of Genetics and Developmental Biology University of Connecticut Health Center, Farmington, CT 06030-
dc.description.affiliationInformatics J. Craig Venter Institute, Medical Center Drive, Rockville, MD 20850-
dc.description.affiliationDepartamento de Genética, Evolução e Bioagentes Instituto de Biologia Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-862-
dc.description.affiliationDepartamento de Genética e Melhoramento Universidade Federal de Viçosa, MG 36570-000-
dc.description.affiliationCentro de Apoio Multidisciplinar Universidade Federal Do Amazonas, Manaus, AM 69077-000-
dc.description.affiliationDepartamento Biologia Geral Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG 36571-000-
dc.description.affiliationLaboratório de Biologia Molecular Instituto de Ciências Biológicas Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO 74001-970-
dc.description.affiliationDivisão de Recursos Microbianos Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas Universidade Estadual de Campinas, Paulinia, SP 13140-000-
dc.description.affiliationCentro de Biologia Molecular e Engenharia Genética Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-875-
dc.description.affiliationDepartamento de Biotecnologia Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, PB 58051-900-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Geral Universidade Estadual de Londrina, Londrina, PR 86055-990-
dc.description.affiliationInstituto de Bioquímica Médica Universidade Federal Do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ 21941-902-
dc.description.affiliationPrograma de Pósgraduac ̧ão em Genética Conservação e Biologia Evolutiva Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, AM 69067-375-
dc.description.affiliationLaboratório Nacional de Ciência e Tecnologia Do Bioetanol CTBe, Campinas, São Paulo, SP 13083-970-
dc.description.affiliationDepartamento de Ciências Farmacêuticas Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP 14040-903-
dc.description.affiliationCoordenação de Biodiversidade Laboratório Temático de Biologia Molecular Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, AM 69060-001-
dc.description.affiliationLaboratory of Malaria and Vector Research NIAID NIH, Bethesda, MD 20817-
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Biologia Molecular Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG 36570-000-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Celular e Genética Universidade Federal Do Rio Grande Do Norte, Natal, RN 59072-970-
dc.description.affiliationPrograma de Pós-Graduação de Genética e Biologia Molecular Instituto de Biociências Universidade Federal Do Rio Grande Do sul, Porto Alegre, RS 90150-197-
dc.description.affiliationInstituto de Ciências Biológicas Departamento de Biologia Celular Universidade de Brasília, Brasília, DF 70910-900-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, PE 50740-520-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP 14040-901-
dc.description.affiliationInstituto de Ciências Biológicas Universidade Federal Do Pará, Belém, PA 66075-970-
dc.description.affiliationPrograma de Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF 70790-160-
dc.description.affiliationEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária Soja, Londrina, PR 86001-970-
dc.description.affiliationEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária CNPSA, Concórdia, SC 89700-000-
dc.description.affiliationDepartamento de Biologia Vegetal Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-970-
dc.description.affiliationLaboratório de Vetores da Malária e Dengue Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia, Manaus, AM 69067-375-
dc.description.affiliationLaboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP 13083-875-
dc.description.affiliationDepartamento de Bioquímica e Imunologia Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901-
dc.description.affiliationInstituto de Biofísica Carlos Chagas Filho Universidade Federal Do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ 21941-902-
dc.description.affiliationDepartamento de Parasitologia Instituto de Ciências Biomédicas Universidade de São Paulo, São Paulo, SP 05508-000-
dc.description.affiliationUnespDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal UNESP - Universidade Estadual, Paulista, SP 14884-900-
dc.rights.accessRightsAcesso restrito-
dc.relation.ispartofNucleic Acids Research-
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