Avaliação de métodos de identificação e determinação do perfil de sensibilidade aos antimicrobianos em staphylococcus spp. isolados de pacientes com infecção do trato urinário (ITU)

Abstract

A infecção do trato urinário (ITU) é uma das infecções mais comuns na prática clínica, sendo S. saprophyticus o segundo agente mais frequente na comunidade. Esse estudo objetivou comparar três métodos fenotípicos de identificação e avaliar o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos em Staphylococcus spp. isolados de pacientes com ITU. As 101 amostras de estafilococos isoladas foram identificadas pelo disco de novobiocina, Vitek I e método simplificado de provas bioquímicas, utilizando como referência o método genotípico ITS-PCR. A prova da DNAse teve uma boa correlação com a coagulase em tubo, apresentando 100,0% sensibilidade e 97,6% de especificidade. No teste de concordância entre os métodos de identificação, o método simplificado de provas bioquímicas obteve taxas de concordância de 98,0% em relação ao ITS-PCR, enquanto que com o Vitek I foi de 81,2%, e com o disco de novobiocina de 89,1%. O maior percentual de resistência encontrado foi à oxacilina (78,0%) seguido da penicilina (73,0%), sendo todas as amostras sensíveis à vancomicina, linezolida e nitrofurantoina. Os 17 isolados de S. aureus encontrados foram identificados corretamente por todos os métodos e os que carreavam o SCCmec do tipo III foram os que apresentaram maior resistência aos antimicrobianos. Das 18 amostras de estafilococos mecA positivos encontradas neste estudo, 15 (83,3%) foram resistentes aos discos de cefoxitina e oxacilina concomitantemente, além disso foram resistentes também à oxacilina pelo E-test® e pelo Vitek I. Dos 57 S. saprophyticus, 7 (12,3%) foram resistentes ao disco de cefoxitina e nenhum apresentou o gene mecA, enquanto 56 (98,2%) demonstraram resistência ao disco de oxacilina, sendo que todos foram resistentes pelo E-teste® e pelo Vitek I e somente dois apresentaram o gene mecA e carreavam o SCCmec do tipo IV. Em relação aos métodos de detecção...

Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infections in clinical practice, and S. saprophyticus is the second most frequent agent in the community. This study aimed at comparing three phenotypic methods to identify and evaluate the sensitivity profile to antimicrobials in Staphylococcus spp. isolated from patients with UTI. The 101 samples of staphylococcus isolated were identified by novobiocin disks, Vitek I and the simplified method of biochemical tests, using the ITS-PCR genotypic method as reference. The DNAse test showed good correlation with tube coagulase, exhibiting 100.0% sensitivity and 97.6% specificity. In the agreement test between the identification methods, the simplified method of biochemical tests showed agreement rates of 98.0% in relation to ITS-PCR, whilst with Vitek I, it was of 81.2%, and with the novobiocin disk, it was of 89.1%. The highest resistance percentage found was to oxacillin (78.0%), followed by penicillin (73.0%), and all samples were sensitive to vancomycin, linezolid and nitrofurantoin. The 17 isolates of S. aureus found were correctly identified by all methods, and those carrying type-III SCCmec showed the greatest resistance to antimicrobials. Of the 18 mecA-positive staphylococcus samples found in this study, 15 (83.3%) were concomitantly resistant to cefoxitin and oxacillin disks. Additionally, they were also resistant to oxacillin by the E-test® and by Vitek I. Of the 57 S. saprophyticus, 7 (12.3%) were resistant to the cefoxitin disk, and none showed the mecA gene, while 56 (98.2%) showed resistance to the oxacillin disk, all of them were resistant by the E-test® and by Vitek I, and only two showed the mecA gene and carried the type-IV SCCmec. As regards the detection methods for oxacillin resistance, the diffusion technique with oxacillin disks, E-test® and Vitek I showed greater sensitivity (94.4%) and lower specificity... (Complete abstract click electronic access below)