O MHAR é resultado da iniciativa de pesquisadores e bolsistas, que apoiados pela Reitoria e Pró-reitorias de Extensão, Pesquisa, Ensino e Administração da UNESP, também pelas Unidades Universitárias da FAAC de Bauru, FEG de Guaratinguetá, FCL de Araraquara, FD de Franca, FE de Itapeva, FPS de Assis, FEB de Bauru e CEDEM de São Paulo.

Possui como parceiros fundamentais tecnológicos e operacionais o NEAD - Núcleo de Ensino à Distância e o Acervo Digital da UNESP.

Como Parceiros Institucionais atuais destacam-se:

1- A Prefeitura Municipal de São Luiz do Paraitinga através das Secretarias de Planejamento, Obras, Turismo, Cultura, Saúde, Jurídica, Administrativa, Assistência Social, Agricultura, Esporte e Lazer e Comunicação entre outras diretorias.

2- A Câmara Municipal de São Luiz do Paraitinga,

3- Os Conselhos Municipais de: Planejamento - COMUPLAN, Turismo - CONTUR, Meio Ambiente - COMEIA, Defesa do Patrimônio Cultural - CMDPC, Agricultura - COMAGRI.

Com enorme potencial de aprimoramento para parcerias institucionais futuras encontram-se as seguintes instituições: Instituo do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional - IPHAN, o Conselho de Defesa do Patrimônio Histórico, Artístico, Arqueológico e Turístico do Estado de São Paulo, o Instituto Elpídio dos Santos de São Luiz do Paraitinga - IES, O Museu Oswaldo Cruz de São Luiz do Paraitinga, A Universidade de Taubaté - UNITAU entre outras instituições.